Il clima di Samos è caldo moderato d’estate e mite d’inverno. Gli sbalzi di temperatura sono molto limitati e non si scende mai comunque sotto gli 0°C. A causa dei rilievi montagnosi, l’isola registra una grande quantità di pioggia; le precipitazioni ammontano a 918,4 mm e dicembre è il mese più piovoso in assoluto, con il 23% del totale. La maggior parte degli acquazzoni si verificano d’inverno, mentre le estati sono piuttosto secche; dalla metà di aprile fino ad ottobre le piogge sono scarse, tuttavia durante la primavera causano a volte gravi danni.

 

I venti che raggiungono l’isola provengono prevalentemente da nord e soffiano continuamente durante l’estate; d’inverno si aggiungono quelli provenienti da sud, che causano le precipitazioni.

 

La zona meridionale dell’isola è più secca di quella settentrionale e maggiormente esposta ai venti.

 

Samos è uno dei luoghi che vanta i periodi di sole più estesi tra tutte le regioni della Grecia, infatti è possibile non avvistare una nuvola per più di sei mesi consecutivi.